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3D structure of a heparin mimetic analogue of a FGF-1 activator. A NMR and molecular modelling study

IIQ

Juan C. Muñoz-García, Cristina Solera, Paula Carrero, José L. de Paz, Jesús Angulo, Pedro M. Nieto Organic & Biomolecular Chemistry 2013, Vol. 11, 8269-8275

El comportamiento hidrodinámico de oligosacáridos de heparina puede ser descrito como un rotor trompo simétrico con dos ejes de rotación perpendiculares. Esto permite la determinación de distancias interprotónicas con precisión mediante experimentos de RMN basados en NOESY/ROESY. En este trabajo, describimos la estructura en disolución del hexasacárido 1, elucidada a partir de distancias precisas obtenidas mediante experimentos ROESY off-resonance y 500 nanosegundos de simulación de dinámica molecular. En estudios previos, observamos que un hexasacárido sintético con sus grupos sulfato dirigidos hacia la misma cara del eje molecular (2) dió lugar a una actividad biológica opuesta a 1, esto es, mientras que el último es incapaz de activar la ruta de señalización de FGF-1, 2 es incluso más activo que un hexasacárido mimético de la región regular de la heparina (3). A partir del presente análisis estructural se concluye que 1 presenta unas características tridimensionales similares a 2 y 3 y, por tanto, sus diferentes actividades se deben probablemente a la disposición de los grupos sulfato en la secuencia hexasacarídica.

The motional behaviour of heparin oligosaccharides in solution is best described as a top rotor having two perpendicular rotation axes. This permits an accurate extraction of interprotonic distances by NOESY/ROESY based methods. In this paper, we describe the solution structure of the hexasaccharide 1 calculated from very precise distance data obtained from off-resonance ROESY experiments and a 500-nanosecond MD simulation. In previous studies, we found that a synthetic hexasaccharide having the sulphate groups directed towards the same side of the molecular axis (2) gave rise to the opposite biological activity to 1, i.e., while the latter is unable to activate the FGF-1 signalling pathway, 2 is even more active than an hexasaccharide of the regular region of heparin (3). From the structural analysis, it has been concluded that 1 has similar threedimensional characteristics to 2 or 3 and therefore the differences in activity should be due to the arrangement of the sulphate groups within the hexasaccharidic sequence.